phpMyAdmin の処理がタイムアウトするなどして正常にエクスポートできなかった可能性があります。
テーブルごとにエクスポートするなど、分割してエクスポートしてください。
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専用サーバーをご利用中の場合
phpMyAdmin をコントロールパネルの 簡単インストール よりインストールしてエクスポートをお試しください。専用サーバーにインストールした phpMyAdmin であれば、コントロールパネルからPHPの設定を(max_execution_time, memory_limit の値を大きくするなど)調整することで、正常にエクスポートできます。
